En la Educación Primaria el centro se propone que los alumnos, con la ayuda de sus profesores y en coordinación con la familia, construyan su propio aprendizaje, por lo que se fomenta y valora la capacidad de esfuerzo. En este nivel de estudios se emplea una metodología:
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Orientativa: el profesor es el guía que motiva, estimula, propone, organiza y hace más gratificante la actividad del alumno.
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Globalizadora: trata de integrar cada conocimiento en el contexto de su realidad.
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Realista y funcional: cada conocimiento debe tender a crear un hábito útil para la vida cotidiana.
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Flexible: dirigida a todos los alumnos, pero atendiendo a la singularidad de cada uno, dándole la atención adecuada y personalizada que necesite.
Gracias a las bibliotecas de aula, se fomenta el interés por la lectura, interés que se continúa y amplía con la Biblioteca General del centro y con la realización en ésta de fichas bibliográficas.
En cuanto a la actividad pastoral, ésta está a cargo de los sacerdotes, del coordinador de Pastoral y de los tutores, siendo la Comisión de Pastoral la que marca las pautas a seguir en lo que se refiere a las actividades religiosas que se desarrollan en el colegio. Dentro de la formación religiosa que se imparte a los alumnos en esta etapa, destaca para 2º EP. el Despertar Religioso, la Catequesis 3° y 4° EP., la Primera Comunión 4° EP. y la Post-Comunión para 5º y 6º EP.
Igualmente, se organiza para los estudiantes un amplio abanico de actividades complementarias y extraescolares adaptadas a su edad.